La plateforme Histomics met à votre disposition un ensemble d’équipements ainsi que des postes de travail indispensables à la mise en œuvre de vos techniques d’histologie.
Tous les équipements ci-dessous sont accessibles en mise à disposition, formation et/ou prestation.
Comment venir travailler sur la plateforme ?
Automate Bond RX
De l’IHC à l’IF, en passant par le HIS et le multiplexage et bien plus encore, le BOND RX offre un moyen simple d’automatiser rapidement les analyses manuelles.
Le système BOND a une capacité de 30 lames, trois séries d’au plus dix lames chacune peuvent être traitées simultanément, avec différents protocoles si nécessaire, chaque série démarrant séparément afin d’assurer un traitement continu.
Coupe histologique
Cryostats
Leica : 4 CM3050S MMFrance : 1 NX50, 1 HM560 Les lames anti-roll, rasoir et liquide OCT sont à disposition sur la plateforme. |
Microtomes à paraffine
Leica : 1 RM2245
MMFrance : 1 HM340E Bain-marie et plaque chauffante pour la récupération de vos coupes sont à disposition sur la plateforme ainsi que des étuves pour le séchage. |
Microtomes à congélation
MMFrance : 3 HM450 Microtomes à congélation équipés de système de refroidissement permettant le maintien de la température de la platine jusqu’à -40°C. Des tubes, plaques de cultures et autres contenants sont à votre disposition au niveau des microtomes. |
Vibratomes
Leica : 1 VT1000S, 1 VT1200 MMFrance : 1 HM650V Des tubes, plaques de cultures et autres contenants sont à votre disposition au niveau des vibratomes. |
Inclusion en paraffine
Automate imprégnation
MMFrance : STP120
Le STP120 est un automate de déshydratation de type carrousel destiné aux processus de fixation, déshydratation, clarification et imprégnation en paraffine des tissus qui permet de traiter jusqu’à 100 échantillons à la fois.
Différents programmes d’imprégnation sont possibles en fonction de la nature et de la taille de vos échantillons. N’hésitez pas à nous consulter.
Des consommables (Cassettes de différentes tailles, mousses, …) pour la préparation de vos échantillons sont disponibles au niveau de la plateforme.
Procédure Préparation Echantillon pour Inclusion Paraffine.
Toutes les imprégnations en paraffine doivent faire l’objet d’une demande de prestation.
Station enrobage
Leica : EG1150 H+C
La station d’enrobage Leica EG1150 H+C est composé de 2 modules:
- Un module chauffé de distribution de paraffine d’une capacité de 3 litres, avec un plan de travail chauffé et spacieux et des zones de rangement pour les cassettes et les moules d’inclusion
- Une plaque froide
Acquisition
Axioscope
Illumination : Fluorescence
Objectifs : 5X – 10X – 20X – 40X – 63X Filtres : DAPI – FITC – CY3 – CY5 |
Axioscope (double tête)
Illumination : Lumière transmise
Objectifs : 5X – 10X – 20X – 40X – 63X Filtres : NA |
Strereomicroscope
Illumination : Fluorescence & lumière Transmise Objectifs : 1X – 2X (avec grossissement de 0,73 à 12 fois) Filtres : DAPI – FITC – CY3 |
Station Mantra2 (camera multispectrale)
Illumination : Fluorescence & lumière Transmise
Ojectifs : 4X – 10X – 20X Filtres : DAPI – FITC – CY3 – TXred – CY5 – 480 |
Scanners de lames
Axioscan Z1
Capacité : 100 lames
Illumination : Fluorescence & lumière Transmise
Objectifs : 2.5X – 5X – 10X – 20X – 40X
Filtres : DAPI – FITC – CY3 – CY5
Nanozoomer S60
Capacité : 60 lames
Illumination : Fluorescence & lumière Transmise
Objectifs : 20X – 40X
Filtres : DAPI – FITC – CY3 – CY3.5 – CY5
La formation est obligatoire avant toute utilisation des scanners. Comment faire une demande de formation ?
Microdissecteur laser
Leica : LMD7000
Le système de microdissection laser Leica LMD7000 permet à l’utilisateur de tracer facilement des régions d’intérêt pour la dissection et la collecte de cellules ou de zones tissulaires d’intérêt. Le laser est monté sur un microscope droit. Sur ce système c’est le laser qui se déplace, et non l’échantillon. Celui-ci tombe par gravité dans la capsule de réception ce qui permet d’obtenir des échantillons disséqués parfaitement coupés, exempts de contamination et prêts pour l’analyse.
La formation est obligatoire avant toute utilisation de cet équipement. Comment faire une demande de formation ?
GeoMx Digital Spatial Profiler
GeoMx DSP est un instrument utilisé dans la transcriptomique spatiale pour collecter des informations relatives aux transcriptomes des régions d’interet sur une coupe de tissu. GeoMx DSP est équipé d’un moniteur LED couleur de 27″ (4K – 8MP, modèle : LG 27HJ712C-W) et 4 filtres (FITC 525 nm; Cy3 568 nm; Texas Red 615 nm, Cy5 666 nm). Avec un million de micromiroirs intégrés, il est capable de s’adapter à n’importe quelle forme or taille des régions sélectionnées sur le tissu. Ces micromiroirs dirigent la lumière UV vers les zones d’interet. Les sondes hybridées au ARNm contenant des code-barres spatiaux sont ainsi photoclivés. Des oligonucléotides servant de barre-codes spatiaux sont aspirés et collectés dans une plaque à 96 puits pour une analyse de transcriptomes.
Colorations
2 postes de travail
La plateforme met à votre disposition un ensemble de colorants pour des colorations de type morphologique (eg HE, Cresyl violet, etc.) et d’autres pour l’identification de stigmates histopathologique (eg rouge Congo, thioflavineS etc.).
Immunohistochimies
10 postes (paillasses) de travail
La plateforme met à disposition un ensemble de réactifs pour la réalisation de vos immunohistochimies (ex : serum, BSA, anticorps secondaires fluorescents, système de révélation, DAB, Dapi, milieu de montage, …etc). Les anticorps primaires restent à la charge des utilisateurs.
N’hésitez pas à nous contacter pour discuter de votre besoin
Transparisation des tissus
Méthode Clarity
Méthode DISCO
Hybridation In Situ
Technologie RNAscope à haute sensibilité (kits de réactifs fournis par la plateforme à l’exception des sondes ARN)
Confinement L2
La plateforme possède un secteur de confinement L2 pour la manipulation d’échantillons « à risques » (eg tissu humain). Cet espace est équipé de :
- 1 cryostat Leica CM1950
- 1 vibratome Leica VT1000S
- 1 microtome à paraffine Leica RM2245
- 1 microtome à congélation MMFrance HM450 équipé d’une grande platine
- 3 postes de travail pour les immunohistochimies et/ ou colorations
- 1 sorbonne
N’hésitez pas à nous contacter si vous avez besoin d’informations complémentaires.
L’accès à ce confinement L2 est règlementé.